您所在的位置:首頁 > 腎內(nèi)科醫(yī)學進展 > 腎透明細胞癌的全面分析
腎癌是泌尿系統(tǒng)腫瘤中致死率最高的一種,其發(fā)病率和死亡率約占全部腫瘤的2%.其中,腎透明細胞癌(clear-cell renal cell carcinoma,ccRCC)是腎癌中最常見、惡性程度最高的一種亞型,每年全世界大約會有102,000例患者因此而死亡。
來自東京大學、京都大學及日本其他研究機構(gòu)的研究人員對腎透明細胞癌進行了整合的基因組和轉(zhuǎn)錄組分析。該研究成果于6月24日在線發(fā)表于《Nature Genetics》上。
在這項研究中,為了全面鑒定促成腎透明細胞癌的突變,研究人員對100多個腎透明細胞癌病例開展了一項整合分析。他們使用Illumina的HiSeq 2000儀器對14個病例的腫瘤-正常樣本進行了全基因組測序。之后,那些樣本,以及另外92個病例的腫瘤-正常樣本也經(jīng)過了全外顯子組測序和RNA測 序。
之前關(guān)于腎透明細胞癌的研究表明,泛素介導的蛋白降解通路(UMPP)中相關(guān)基因的突變頻率較高,其中VHL基因突變頻率最高,而成為廣泛研究的對象。2011年底,華大基因、北京大學深圳醫(yī)院等單位曾對UMPP相關(guān)基因突變進行研究,表明非-VHL的UMPP基因也在腫瘤發(fā)展過程中發(fā)揮著重要的作用。
為了補充這些數(shù)據(jù),研究小組還對240個配對的腫瘤-正常樣本進行了深度靶向測序和基于芯片的甲基化、拷貝數(shù)和基因表達評估。測序?qū)嶒炘贗llumina MiSeq平臺上開展,而芯片則分別來自Illumina、Affymetrix和安捷倫。
與之前的工作一致,研究小組的分析發(fā)現(xiàn)了多個突變和遺傳變異,讓VHL基因失活。此外,他們發(fā)現(xiàn),VHL基因及同一條染色體上的其他三個基因(SETD2、BAP1和PBRM1)屬于腎透明細胞癌中最頻繁突變的五大基因。
在研究的發(fā)現(xiàn)階段,研究人員特地挑選了一些腫瘤不帶有明顯VHL改變的個體。對于其中一些腫瘤,他們發(fā)現(xiàn)了TCEB1的頻繁突變,這阻止了Elongin C與VHL的結(jié)合,導致HIF累積。
此外,研究人員還總結(jié)了腎透明細胞癌中經(jīng)常突變的通路和元件,包括PI3K-AKT-mTOR信號通路、KEAP1-NRF2-CUL3復合物、DNA甲基化、p53相關(guān)通路和mRNA加工等。
研究人員認為,通過整合多層次的分析,他們揭開了體細胞突變、DNA甲基化、基因表達和拷貝數(shù)改變之間的獨特關(guān)聯(lián),實現(xiàn)了腎透明細胞癌患者的臨床風險分層。
糖尿病患者易形成心血管疾病及非心血管疾病并發(fā)癥。在不同的研究中,急性腎損傷...[詳細]
Eculizumab可用于治療陣發(fā)性睡眠性血紅蛋白尿癥(PNH),通用名為...[詳細]
意見反饋 關(guān)于我們 隱私保護 版權(quán)聲明 友情鏈接 聯(lián)系我們
Copyright 2002-2024 Iiyi.Com All Rights Reserved