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Nature:決定蛋白命運(yùn)的轉(zhuǎn)折點(diǎn)

2014-06-24 10:28 閱讀:12859 來(lái)源:生物360 責(zé)任編輯:張子玲
[導(dǎo)讀] 偶然事件對(duì)歷史的進(jìn)程有著深遠(yuǎn)的影響。如果費(fèi)迪南大公的司機(jī)沒(méi)有怪錯(cuò)彎,那么他還會(huì)撞在***的槍口上么?第一次世界大戰(zhàn)還會(huì)在那時(shí)候打起來(lái)么?希特勒會(huì)不會(huì)晚幾十年才掌權(quán)呢?

    偶然事件對(duì)歷史的進(jìn)程有著深遠(yuǎn)的影響。如果費(fèi)迪南大公的司機(jī)沒(méi)有怪錯(cuò)彎,那么他還會(huì)撞在***的槍口上么?第一次世界大戰(zhàn)還會(huì)在那時(shí)候打起來(lái)么?希特勒會(huì)不會(huì)晚幾十年才掌權(quán)呢?
 


    對(duì)于這類(lèi)問(wèn)題歷史學(xué)家們只能靠猜,而進(jìn)化生物學(xué)家們卻可以通過(guò)實(shí)驗(yàn)來(lái)解決。日前,科學(xué)家們“復(fù)活了”一個(gè)重要人類(lèi)蛋白的遠(yuǎn)古祖先,研究了它那不斷突變的蛋白進(jìn)化史,分析了其中的大量可變事件(alternative histories)。

    研究顯示,只有先出現(xiàn)兩個(gè)特殊的突變,古代蛋白才有可能進(jìn)化成現(xiàn)代的糖皮質(zhì)激素受體(GR)。這兩個(gè)“許可性”突變(permissive mutations)對(duì)蛋白功能沒(méi)有影響,但它們是功能性突變的關(guān)鍵基礎(chǔ)。研究人員篩查了數(shù)千種進(jìn)化路徑,他們發(fā)現(xiàn)古代GR進(jìn)化出對(duì)皮質(zhì)醇的敏感性只有一條途徑。相關(guān)研究論文刊登在了近期出版的《Nature》雜志上。

    論文資深作者 Joe Thornton 教授表示:“這種關(guān)鍵蛋白之所以能夠存在,是因?yàn)槌霈F(xiàn)了一個(gè)命運(yùn)轉(zhuǎn)折點(diǎn)。很可能我們機(jī)體內(nèi)許多系統(tǒng)的進(jìn)化,都依賴于進(jìn)化史中非常罕見(jiàn)的偶發(fā)事件。”

    Thornton一直致力于古代蛋白的重建,通過(guò)基因測(cè)序和計(jì)算方法在進(jìn)化樹(shù)中追溯過(guò)去,就像一次“時(shí)空旅行”.他推斷古代蛋白的可能序列,通過(guò)生化方法進(jìn)行合成,并將其引入***生物研究它們的功能。

    Thornton等人之前證實(shí),現(xiàn)代蛋白的進(jìn)化依賴于許可性突變的出現(xiàn),但沒(méi)人知道許可性突變是不是只有一種可能。為此Thornton和俄勒岡大學(xué)的Michael Harms博士合作對(duì)GR進(jìn)行了研究。他們重建了存在于四億五千萬(wàn)年前的古代GR,那時(shí)它還沒(méi)有進(jìn)化出對(duì)皮質(zhì)醇的敏感性。

    研究人員發(fā)現(xiàn),拋開(kāi)許可性突變只引入功能性突變,古代GR就不能進(jìn)化成現(xiàn)在的樣子。隨后,他們構(gòu)建了數(shù)百萬(wàn)個(gè)古代GR的基因拷貝,并向每個(gè)拷貝引入隨機(jī)突變,模擬進(jìn)化中的各種可能。他們還設(shè)計(jì)了基因工程酵母,這些酵母只有在出現(xiàn)功能性GR時(shí)才能生長(zhǎng)。研究人員將各種突變GR引入這種酵母,一旦出現(xiàn)任何許可性突變,GR功能就能恢復(fù),允許酵母生長(zhǎng)。研究顯示,除了現(xiàn)實(shí)中的兩種許可性突變,其他突變都不能恢復(fù)GR的功能。

    研究人員深入解析了突變對(duì)古代蛋白的結(jié)構(gòu)影響,找到了許可性突變?nèi)绱撕币?jiàn)的原因。這樣的突變必須滿足三個(gè)條件:必須穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)中的特定區(qū)域,在功能性構(gòu)象之間維持正確的能量平衡,并且能夠與原始結(jié)構(gòu)和衍生結(jié)構(gòu)都兼容。很少有突變能符合這么嚴(yán)格的限制條件。

    這項(xiàng)研究有助于人們進(jìn)一步理解蛋白功能的進(jìn)化過(guò)程。“能夠直接研究可變歷史事件是很令人興奮的,”Thornton說(shuō)。“如果進(jìn)化史重來(lái)一遍,結(jié)果很可能是完全不同的。對(duì)于細(xì)胞的生化系統(tǒng)來(lái)說(shuō),不可預(yù)測(cè)的遺傳學(xué)事件,在開(kāi)啟一扇進(jìn)化之門(mén)的同時(shí),也關(guān)閉了其他的可能。”


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