作為全球知名的華人科學(xué)家,鄧興旺教授今年上半年新當(dāng)選為美國國家科學(xué)院院士,同時其研究組也獲得了不少重要的新成果,如去年年初他曾與清華大學(xué)施一公教授等共同解析了植物擬南芥感受紫外線B波段光受體UVR8的晶體結(jié)構(gòu).近期鄧興旺教授研究組又接連發(fā)表PNAS等雜志論文,取得了擬南芥UV-B光信號轉(zhuǎn)導(dǎo),以及水稻高密度SNP基因分型研究新成果.

　　第一篇文章:A High Density SNP Genotyping Array for Rice Biology and Molecular Breeding由鄧興旺教授,張啟發(fā)教授等人合作完成,分析測評了一種高密度SNP基因分型芯片分析技術(shù),指出這種技術(shù)未來將會在功能基因組研究和分子育種中發(fā)揮重要作用.

　　高密度單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析對于遺傳學(xué)家和分子育種學(xué)家來說十分重要,隨著大量的基因組測序數(shù)據(jù),以及精確SNP檢測技術(shù)的積累發(fā)展,目前已經(jīng)實現(xiàn)了水稻高質(zhì)量高密度SNP芯片分析.

　　在這篇文章中,研究人員報道了一種高密度水稻SNP芯片分析及其應(yīng)用的發(fā)展.他們通過篩選來自801種水稻品種重測序數(shù)據(jù)中超過1000萬個SNP位點,利用Illumina的Infinium平臺中一種稱為RiceSNP50的芯片進行分析.這種芯片共有51,478個均勻分布的標記,其中68%存在于基因區(qū)域內(nèi).

　　實驗結(jié)果表明芯片基因分型準確率高,應(yīng)用方面廣泛,比如可以用于高分辨率收集優(yōu)質(zhì)水稻品種核心種質(zhì).同時研究人員通過全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)也準確識別出了一個特征QTL.此外,這一芯片也被成功地用于多種驗證和特質(zhì)分析過程.

　　這些研究結(jié)果表明RiceSNP50是一種精確高通量基因分型工具,未來將會在功能基因組研究和分子育種中發(fā)揮重要作用.