目前中國科學(xué)家廣泛運(yùn)用GWAS對共28種疾病進(jìn)行了疾病遺傳易感性的研究,占國際總研究病種的17.8%,可分為精神類疾病(如精神分裂癥、躁郁癥、癲癇)、腫瘤性疾病(如肝癌、胃癌、肺癌、食管癌、胰腺癌、前列腺癌)、代謝類疾?。ㄈ?型糖尿病、多囊卵巢綜合癥、骨質(zhì)疏松癥)、心血管疾?。ㄈ绻谛牟?、高血壓病)、自身免疫性疾病(如Graves病、IgA腎病和強(qiáng)直性脊柱炎的),眼科疾?。ㄈ绺叨冉暎⑵つw復(fù)雜性疾?。ㄈ缦到y(tǒng)性紅斑狼瘡、銀屑病、麻風(fēng)、白癜風(fēng)、特應(yīng)性皮炎)。
主要的研究成果包括:
Genome-wide association study identifies a susceptibility locus for schizophrenia in Han Chinese at 11p11.2
精神分裂癥是一種以行為紊亂、言語凌亂、情感淡漠和認(rèn)知障礙為主要臨床表現(xiàn)的嚴(yán)重精神障礙性疾病。中國人群GWAS已經(jīng)鑒定出了8個精神分裂癥遺傳易感位點(diǎn),為揭示精神分裂癥發(fā)病機(jī)制提供了直接的遺傳學(xué)證據(jù)。
比如去年國內(nèi)研究組對分別來自中國北方、中部和南方的10,218名受試者(其中包括3750名精神分裂癥患者,以及6468名未患該病的對照個體)進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析。在隨后的研究中進(jìn)一步對另一組8922名受試者(其中包括4383名精神分裂癥患者,以及4539名對照個體)進(jìn)行了檢測,鑒別出了2個與精神分裂癥相關(guān)的風(fēng)險位點(diǎn)8p12 和1q24.2。
“這些基因位點(diǎn)為我們了解精神分裂癥提供了新的潛在靶標(biāo)。由于此前我們僅知道少數(shù)的基因易感位點(diǎn),這兩項(xiàng)研究無疑將其向前推動了一大步,”美國紐約西奈山醫(yī)學(xué)院精神病基因組學(xué)負(fù)責(zé)人Pamela Sklar說。
此外,這幾項(xiàng)相關(guān)研究也再次驗(yàn)證了此前來自歐洲研究團(tuán)體的發(fā)現(xiàn):在6號染色體上一個與主要組織相容性復(fù)合體(MHC)相關(guān)的區(qū)域,也與精神分裂癥發(fā)病相關(guān)。麻省總醫(yī)院的Shaun Purcell和芝加哥大學(xué)普利茲克醫(yī)學(xué)院精神病學(xué)研究人員Pablo Gejman高度稱贊這一驗(yàn)證結(jié)果具有非常重大的意義,它進(jìn)一步表明了在這一廣闊的區(qū)域有1個或多個遺傳因子與這一疾病的風(fēng)險相關(guān),從而向研究人員提出了從前未曾考慮并足夠重視的疾病病因機(jī)制。
A genome-wide association study identifies two new risk loci for Graves' disease
Graves病是一種以甲狀腺功能亢進(jìn)和出現(xiàn)促甲狀腺激素受體抗體為特征的自身免疫性疾病。中國人群GWAS研究在Graves病患者中共發(fā)現(xiàn)了6個易感基因位點(diǎn),使人們對Graves病的遺傳學(xué)發(fā)病機(jī)制有了更進(jìn)一步的認(rèn)識。GWAS發(fā)現(xiàn)的易感位點(diǎn)還可以作為未來開展疾病基因診療的靶標(biāo)。
去年國內(nèi)學(xué)者對3052名受試者(其中包括1536名Graves病患者,以及1516名未患該病的對照個體)進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析。在隨后的研究中進(jìn)一步對另一組7504名受試者(其中包括3994名Graves病患者,以及3510名對照個體)進(jìn)行了檢測,他們鑒定出了6個與Graves病相關(guān)聯(lián)的風(fēng)險位點(diǎn),除了從前報(bào)道過的MHC、TSHR、CTLA4和FCRL3四個基因位點(diǎn)外,他們還發(fā)現(xiàn)了兩個新的基因位點(diǎn),一個是位于染色體上的6q27區(qū)域內(nèi)的RNASET2,另一個是4p14區(qū)域內(nèi)的GDCG4p14基因。
這項(xiàng)研究不僅找到了與甲亢發(fā)病相關(guān)的兩處新的染色體變異區(qū)域,首次揭示了致病基因差異是導(dǎo)致甲亢藥物治療效果因人而異的原因,初步解開了甲亢發(fā)病機(jī)制的謎團(tuán)。并為甲亢治療方法的竄則和預(yù)后的評估提供了重要的生物標(biāo)志。
Genome-wide association study in a Chinese Han population identifies nine new susceptibility loci for systemic lupus erythematosus
系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)是一種可累及多系統(tǒng)臟器的嚴(yán)重自身免疫性疾病,其臨床表型多樣。中國漢族人群GWAS研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)超過15個易感基因位點(diǎn),表明包含這些位點(diǎn)的免疫相關(guān)性生物學(xué)通路在SLE的發(fā)病中發(fā)揮關(guān)鍵作用。
這些研究成果表明中國GWAS研究已經(jīng)大大拓寬了人們對于常見疾病在遺傳學(xué)發(fā)病機(jī)理方面的理解。一方面篩選得到的不同種群間(包含中國種群)共有易感位點(diǎn)可能在疾病發(fā)病中發(fā)揮更為重要的作用,另一方面不同種群的GWAS研究揭示了各自的特異性易感位點(diǎn),強(qiáng)調(diào)了不同種群間的遺傳異質(zhì)性,這對于提示地域及環(huán)境因素影響疾病發(fā)生發(fā)展有重要的研究意義。由此可見,對中國人群開展更多、更大規(guī)模的GWAS研究以及在不同種群間開展平行GWAS研究的比較是至關(guān)重要的。
文章還指出,在GWAS取得巨大成功的同時,也不能忽略準(zhǔn)確鑒定疾病真正致病變異的問題,這就要求我們要投入更多的精力對疾病易感基因位點(diǎn)進(jìn)行精細(xì)定位和功能學(xué)研究。當(dāng)前復(fù)雜疾病GWAS研究結(jié)果僅能解釋小部分的遺傳發(fā)病風(fēng)險,在已有的GWAS數(shù)據(jù)中仍然存在很多有價值的信息,尚需采用新的分析方法,結(jié)合基因組學(xué)、表觀遺傳學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等研究策略深入挖掘那些GWAS遺漏的疾病遺傳易感信息。這些方法可以幫助人們深入地理解疾病的發(fā)病機(jī)理。雖然中國在GWAS研究領(lǐng)域起步較晚,但近幾年突飛猛進(jìn)的發(fā)展已緊跟世界GWAS發(fā)展步伐,并且將在后GWAS時代中扮演關(guān)鍵角色。
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