目前，癌癥基因組圖譜計劃（The Cancer Genome Atlas，TCGA）的研究人員得出結(jié)論：小分子非編碼RNA（small non-coding RNAs，sncRNAs）可以用來預(yù)測一個人是否患有乳腺癌。這項研究成果發(fā)表在2014年2月17日的國際知名雜志《EMBO reports》上，表明特定類型的非編碼RNA的水平差異，可以用來區(qū)分癌組織和非癌組織，還可以把癌癥患者分成具有不同生存結(jié)果的亞組。

　　sncRNAs是細胞內(nèi)不產(chǎn)生蛋白質(zhì)、但具有其它重要功能的RNA分子。本研究的共同第一作者、加拿大西蒙弗雷澤大學(xué)和不列顛哥倫比亞大學(xué)的教授、BC癌癥機構(gòu)（BC Cancer Agency）的杰出科學(xué)家Steven Jones解釋說：“多年來，靠近轉(zhuǎn)錄起始位點的sncRNAs因其明顯的無序分布，及其與已知功能或疾病之間的相關(guān)性，一直被視為‘轉(zhuǎn)錄噪音（transc**tional noise）’。通過利用一種計算機方法來分析小RNA序列信息，我們可以濾過這些‘噪音’，找到臨床上有用的信息。我們的實驗數(shù)據(jù)表明，位于蛋白編碼基因第一外顯子中的sncRNAs，其表達水平上的全基因組變化與乳腺癌有關(guān)聯(lián)。”

　　這些科學(xué)家，能夠?qū)⒔】等撕腿橄侔┗颊撸ㄔ谶@個例子中是乳腺浸潤性癌）基因轉(zhuǎn)錄起始位點附近發(fā)現(xiàn)的很多不同的sncRNAs區(qū)分開來。他們將這些RNA分子定位到DNA序列上的特定位置，并尋找強烈表達的非編碼RNA與患者（從他們身上分離組織樣本）疾病狀態(tài)之間的相關(guān)性。然后，研究人員檢測了“是否能夠用他們可識別的基因組位置中的小RNA的表達，來預(yù)測另外一組已知患乳腺癌患者的分離組織樣本中存在病變”。這個檢測有效地預(yù)測了新樣本組中的正確疾病狀態(tài)。本文的共同第一作者Athanasios Zovoilis說：“對癌癥狀態(tài)的預(yù)測潛力，僅限于基因轉(zhuǎn)錄起始位點附近發(fā)現(xiàn)的許多sncRNA的一小部分。更重要的是，這些RNA位置富含CpG島（CpG islands）。”CpG島是包含高頻率胞嘧啶和鳥嘌呤的基因組區(qū)域。這些RNA存在于這些島中，可能影響它們參與DNA甲基化過程及疾病的發(fā)生，但是還需要進一步的實驗來探索和證明這種關(guān)聯(lián)性。

　　Jones指出：“這是第一次表明，基因轉(zhuǎn)錄起始位點附近的sncRNA與疾病有關(guān)。當然，還需要進一步的研究工作，但根據(jù)我們的數(shù)據(jù)，我們認為這些sncRNA具有作為一種癌癥預(yù)測工具的相當大的診斷潛力。此外，這些sncRNA可以幫助我們在表觀遺傳學(xué)水平上更好地理解腫瘤發(fā)生的機制，并可產(chǎn)生利用sncRNA的新藥。”研究人員還指出，這類sncRNA，可能對預(yù)測其它類型癌癥或疾病的存在也非常有用。

　　現(xiàn)在，癌癥基因組圖譜計劃產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，可讓我們更容易獲得大量患病組織和正常組織的序列信息，使這樣的研究工作得以進行。目前，癌癥基因組圖譜計劃是現(xiàn)有最大的sncRNA資源之一。