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【盤點(diǎn)】聊聊腸道菌群那些事兒

2015-07-16 11:27 閱讀:2135 來(lái)源:生物谷 責(zé)任編輯:李思民
[導(dǎo)讀] 近年來(lái)關(guān)于腸道菌群的研究不斷涌現(xiàn),腸道菌群在人類健康中的作用也越來(lái)越得到人們關(guān)注。這個(gè)研究探索了腸道微生物菌群對(duì)一周歲內(nèi)的嬰兒發(fā)育的影響,對(duì)更深入研究微生物相關(guān)的代謝和免疫有非常大的意義。
近年來(lái)關(guān)于腸道菌群的研究不斷涌現(xiàn),腸道菌群在人類健康中的作用也越來(lái)越得到人們關(guān)注。腸道菌群是人體腸道的正常微生物,種類繁多,數(shù)目更是驚人。據(jù)估算,一個(gè)正常成人體內(nèi), 腸道細(xì)菌總重量可達(dá)1~1.5kg。它們能夠影響體重和消化能力,抵御感染和自身免疫疾病的患病風(fēng)險(xiǎn),除此之外,還與一些內(nèi)分泌代謝性疾病、腎臟疾病、神 經(jīng)性疾病、心血管疾病、呼吸系統(tǒng)疾病以及癌癥的發(fā)生具有密切關(guān)聯(lián)。生物谷小編對(duì)過(guò)去一段時(shí)間有關(guān)腸道菌群的文章進(jìn)行了盤點(diǎn),跟大伙一起聊聊腸道菌群的那些 事兒。
    1.Science:共生細(xì)菌幫你抗過(guò)敏

    來(lái)自法國(guó)巴斯德研究所的研究人員在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊science發(fā)表了一項(xiàng)最新研究進(jìn)展,他們發(fā)現(xiàn)人體內(nèi)共生菌群能夠調(diào)節(jié)免疫系統(tǒng)平衡,揭示了共生菌群缺失導(dǎo)致過(guò)敏反應(yīng)產(chǎn)生的具體機(jī)制。

    有研究已經(jīng)證明在生命早期共生細(xì)菌發(fā)生變化或缺失會(huì)促進(jìn)2型免疫和過(guò)敏炎癥反應(yīng)的發(fā)生,雖然共生菌群是誘導(dǎo)小腸Th17細(xì)胞和Treg細(xì)胞的強(qiáng)力誘導(dǎo)因素,但其調(diào)節(jié)2型免疫反應(yīng)的機(jī)制一直不清楚。在該項(xiàng)研究中,研究人員利用小鼠進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn)菌群誘導(dǎo)的Treg細(xì)胞能夠表達(dá)核激素受體RORγt。當(dāng)缺少RORγt陽(yáng)性的Treg細(xì)胞,Th2驅(qū)動(dòng)的對(duì)抗蠕蟲(chóng)的免疫防御應(yīng)答更為有效,但與此同時(shí),Th2相關(guān)的病理反應(yīng)也得到放大。因此,研究人員提出共生菌群能夠通過(guò)誘導(dǎo)3型RORγt陽(yáng)性Treg細(xì)胞和Th17細(xì)胞產(chǎn)生調(diào)節(jié)2型免疫應(yīng)答。

    這項(xiàng)研究揭示了共生菌群失衡觸發(fā)過(guò)度的2型免疫應(yīng)答導(dǎo)致過(guò)敏反應(yīng)產(chǎn)生的機(jī)制。這為過(guò)敏性疾病的治療提供了重要理論基礎(chǔ)。
    2.Nature comm:靈芝可調(diào)節(jié)腸道菌群改善肥胖

    **長(zhǎng)庚大學(xué)的研究人員在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊nature communication在線發(fā)表了一項(xiàng)最新研究進(jìn)展,他們通過(guò)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)首次發(fā)現(xiàn)靈芝能夠調(diào)節(jié)小鼠腸道菌群生態(tài),改善肥胖。

    在這項(xiàng)研究中,研究人員從一種名貴中藥--赤芝中提取出一種水提取物(WEGL),將其添加到高脂飲食誘導(dǎo)的肥胖小鼠食物中。研究人員在對(duì)高脂誘導(dǎo)的肥胖小鼠進(jìn)行了該藥物處理之后發(fā)現(xiàn)這些肥胖小鼠表現(xiàn)出體重下降,炎癥改善,胰島素敏感性增加等獲益表型,并且這些小鼠的腸道菌群生態(tài)紊亂也得到了逆轉(zhuǎn),除此之外,小腸屏障的完整度得以維持,還降低了代謝性內(nèi)毒素血癥的水平。研究人員還通過(guò)糞便移植的方法將WEGL處理的小鼠的糞便轉(zhuǎn)移到高脂飲食誘導(dǎo)的肥胖小鼠,也表現(xiàn)出抗肥胖,調(diào)節(jié)腸道菌群的作用。

    這項(xiàng)研究首次發(fā)現(xiàn)靈芝有降低體重調(diào)節(jié)腸道生態(tài)平衡的作用。
    3.Cell:改變腸道菌群 預(yù)防結(jié)腸癌

    來(lái)自美國(guó)St.Jude兒童醫(yī)院的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)一種叫作AIM2的基因發(fā)生缺失會(huì)導(dǎo)致小腸細(xì)胞增殖失控,同時(shí),研究人員還發(fā)現(xiàn)AIM2能夠影響腸道菌群,在腸道中增加“好”細(xì)菌的數(shù)量可能對(duì)于預(yù)防結(jié)腸癌的發(fā)生具有重要意義。

    之前一些研究發(fā)現(xiàn)與AIM2類似的具有病原感受器功能的分子對(duì)于促進(jìn)健康腸道菌群的形成具有重要作用,AIM2是否也會(huì)腸道菌群具有類似的調(diào)節(jié)作用呢?針對(duì)這一問(wèn)題,進(jìn)行該項(xiàng)研究的研究人員就對(duì)正常小鼠和AIM2缺失小鼠的腸道菌群進(jìn)行了對(duì)比,結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩種小鼠在腸道菌群的組成上存在很大不同。為驗(yàn)證腸道菌群是否會(huì)影響結(jié)腸癌進(jìn)展,研究人員將正常小鼠與AIM2缺失小鼠飼養(yǎng)在一起,保證兩種小鼠腸道菌群能夠進(jìn)行一定程度的交換。結(jié)果表明AIM2缺失小鼠的腫瘤數(shù)量大大減少,而正常小鼠的腫瘤數(shù)量則增加。

    這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)參與免疫系統(tǒng)功能發(fā)揮的AIM2基因除在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用,還對(duì)小腸干細(xì)胞的增殖具有調(diào)控作用,AIM2的缺失會(huì)導(dǎo)致小腸干細(xì)胞異常增殖,除此之外還會(huì)影響腸道菌群的組成,進(jìn)而促進(jìn)結(jié)腸癌的發(fā)生。

    4.Cell host &Mircrobe:新生兒腸道微生物菌群研究

    通過(guò)宏基因組測(cè)序分析,科學(xué)家們分析了新生兒和母親腸道菌群,分析了新生兒出生第一年腸道微生物菌群的建立。他們發(fā)現(xiàn),自然生成的嬰兒和剖腹產(chǎn)嬰兒的腸道菌群存在很大差異,前者更接近他們的母親。而且不同時(shí)期的飲食不同,微生物菌群也存在著差異,并隨著時(shí)間變化,微生物菌群趨于穩(wěn)定和成熟,越來(lái)越接近成人腸道微生物菌群。

    斷奶對(duì)嬰兒的腸道微生物菌群的穩(wěn)定也有很大影響。比如,在斷奶之后,微生物菌群變得更加像成年人體內(nèi)的微生物菌群。而且,相對(duì)那些早斷奶的嬰兒,未斷奶的嬰兒腸道微生物菌群顯得更加“年輕”。

    這個(gè)研究探索了腸道微生物菌群對(duì)一周歲內(nèi)的嬰兒發(fā)育的影響,對(duì)更深入研究微生物相關(guān)的代謝和免疫有非常大的意義。

    5.Immunity:腸道微生物關(guān)鍵毒素促進(jìn)炎癥反應(yīng)

    來(lái)自美國(guó)密歇根大學(xué)Gabriel Nú?ez研究組發(fā)現(xiàn)了一類特定的腸道微生物P. mirabilis能夠促進(jìn)腸道NLRP3的激活以及IL-1b的分泌,而這一效應(yīng)是由CCR2+的單核細(xì)胞介導(dǎo)的。

    作者分別利用SPF小鼠與GF小鼠的糞便對(duì)骨髓巨噬細(xì)胞進(jìn)行體外**,結(jié)果顯示:SPF小鼠的糞便能夠引起明顯的IL-1b的分泌,而GF小鼠的糞便則沒(méi)有這一效應(yīng)。之后,作者分別對(duì)SPF小鼠以及GF小鼠(或經(jīng)過(guò)抗生素處理的小鼠)進(jìn)行DSS誘導(dǎo)腸炎的實(shí)驗(yàn)。結(jié)果顯示:DSS誘導(dǎo)之后SPF小鼠腸道固有層細(xì)胞會(huì)有明顯的IL-1b,IL-6以及TNF-a的釋放,而微生物缺失后的小鼠體內(nèi)固有層細(xì)胞則以上因子的分泌明顯減少。這一結(jié)果說(shuō)明腸道的微生物促進(jìn)了小鼠腸道附近的炎癥反應(yīng)。

    隨后,研究人員又利用一系列的篩選實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)在眾多能夠引起IL-1B釋放的細(xì)菌中,P. mirabilis的效應(yīng)最快最強(qiáng)烈。而且這一效應(yīng)也受到NLRP3等一系列炎癥小體蛋白的影響。之后,作者通過(guò)單菌定植的實(shí)驗(yàn)證明了P. mirabilis在體內(nèi)的促炎癥作用。
    6.Cell:特殊腸道菌群揭示致病分子機(jī)制

    來(lái)自加州理工學(xué)院的研究人員通過(guò)研究表明,腸道中的特殊細(xì)菌或?qū)τ跈C(jī)體外周血清素的產(chǎn)生非常重要,而血清素被認(rèn)為是一種大腦神經(jīng)遞質(zhì),大約90%的機(jī)體血清素都是在消化道中產(chǎn)生的,而實(shí)際上改變這種外周血清素的水平或許和很多疾病的發(fā)生有關(guān),比如腸易激綜合征、心血管疾病及骨質(zhì)疏松癥等。

    研究人員通過(guò)研究發(fā)現(xiàn)來(lái)自無(wú)菌小鼠的腸色素細(xì)胞產(chǎn)生的血清素水平大約低于正常菌群小鼠所產(chǎn)生血清素水平的60%,而當(dāng)將正常腸道菌群重新植入無(wú)菌小鼠機(jī)體后,其血清素水平就會(huì)恢復(fù)。

    本文揭示了腸道中存在的正常菌群可以**宿主的腸道細(xì)胞產(chǎn)生血清素,而近年來(lái)微生物組同機(jī)體免疫系統(tǒng)、代謝系統(tǒng)之間的關(guān)聯(lián)也被全世界的科學(xué)家們開(kāi)始重點(diǎn)研究,尤其是對(duì)于揭示腸道微生物在神經(jīng)系統(tǒng)的作用更是讓很多科學(xué)家們非常著迷,而本文研究或?qū)㈤_(kāi)辟一塊新的領(lǐng)域來(lái)加速科學(xué)家們當(dāng)前的認(rèn)知。
    7.腸道微生物會(huì)影響帕金森?!

    來(lái)自芬蘭的研究者們發(fā)表了一項(xiàng)新的研究成果:他們通過(guò)比較正常人與帕金森(PD)患者腸道微生物成分特征,發(fā)現(xiàn)相比于正常樣本,PD患者腸道微生物群中普雷沃氏菌科的豐度發(fā)生了明顯的下降。

    這項(xiàng)研究囊括了72名PD患者(平均年齡65.3歲,48.6%為女性),同時(shí)還包括相同數(shù)量的正常人(平均年齡64.5歲,50%為女性)。通過(guò)收集每位參與者的糞便樣本,研究人員通過(guò)測(cè)序手段檢測(cè)了細(xì)菌16SRNA的V1-V3區(qū)域,進(jìn)而從中選取了4500條序列進(jìn)行分析。分析發(fā)現(xiàn):相比于正常樣本,PD患者糞便中普雷沃氏菌科的細(xì)菌豐度下降了77.6%。

    這項(xiàng)研究還發(fā)現(xiàn)另外一類細(xì)菌:腸桿菌科,它的豐度下降與患者姿勢(shì)不穩(wěn)定以及行動(dòng)困難等癥狀具有相關(guān)性。

    8.PNAS:腸道菌群或決定乙型肝炎急慢發(fā)作

    成人獲得乙型肝炎病毒(HBV)感染后,95%自發(fā)清除;而> 90%新生兒和1-5歲兒童約30%感染肝炎病毒后卻無(wú)法清除,并發(fā)展成慢性感染。來(lái)自**大學(xué)的研究人員解釋腸道菌群或與這種年齡相關(guān)的肝炎發(fā)作有一定關(guān)系。

    研究人員想檢測(cè)腸道菌群的組成是否與HBV感染有相關(guān)性。他們對(duì)一部分成年小鼠使用抗生素治療。其他成年和年輕小鼠都未使用抗生素治療。一般情況下小鼠在6到8周之間腸道菌群出現(xiàn)實(shí)質(zhì)性的變化,9周后趨于穩(wěn)定??股刂委煹男∈?,治療過(guò)程中幾乎檢測(cè)不到腸道菌群直到治療結(jié)束后4天。值得注意的是,治療結(jié)束4周后,腸道微生物依然沒(méi)有回到類似于未治療的成年小鼠的水平。

    未接受抗生素治療的成年小鼠感染HBV后,HBV在6周后檢測(cè)不到。使用抗生素的成年小鼠,60%顯示6周后HBV存在。在年輕小鼠中,90%的顯示HBV在6周后仍在。6個(gè)月后,53%的抗生素成年鼠和80%的年輕小鼠仍然感染了HBV。這些結(jié)果表明,腸道微生物起著對(duì)HBV重要免疫反應(yīng)。
    9.Cell host &microbe:你的腸道菌群誰(shuí)做主?

    來(lái)自加州大學(xué)舊金山分校和哈佛大學(xué)Peter J. Turnbaugh研究小組的科學(xué)家們利用五種不同的近交系小鼠和超過(guò)200只遠(yuǎn)交群小鼠發(fā)現(xiàn)相比于宿主基因型,飲食對(duì)個(gè)體腸道菌群環(huán)境改變起到更為重要作用。

    研究人員發(fā)現(xiàn),在給予近交系小鼠高脂飲食和高糖飲食**后,近交系小鼠的腸道菌群因飲食不同出現(xiàn)兩個(gè)明顯不同的群落,但同時(shí)也發(fā)現(xiàn),不同近交系小鼠在受到高脂和高糖飲食**后,腸道菌群改變的方向也因宿主基因型不同和宿主腸道菌群背景不同而存在差異。同時(shí)在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),飲食對(duì)腸道菌群的影響可能掩蓋了因基因型不同而導(dǎo)致的本已存在的差異。通過(guò)對(duì)遠(yuǎn)交系小鼠的觀察發(fā)現(xiàn),遠(yuǎn)交系小鼠的腸道菌群對(duì)高脂和高糖飲食**呈現(xiàn)快速持久的應(yīng)答??偟膩?lái)說(shuō),腸道菌群的變化對(duì)飲食的應(yīng)答呈現(xiàn)明顯的劑量依賴關(guān)系,飲食的微妙變化會(huì)引起腸道菌群成分結(jié)構(gòu)的改變。

    10. Trends in Microbiology:那些被吃進(jìn)去的益生菌


    近期發(fā)表在《Trends in Microbiology》的綜述文章,具體討論了從食物來(lái)源進(jìn)入腸道的益生菌群體(主要是雙歧桿菌、乳酸菌和丙酸桿菌)是如何影響腸道原有的微生物群體的。從食物中進(jìn)入人體的這三種微生物類群是常用在食品發(fā)酵工業(yè)中的微生物,從數(shù)量上來(lái)說(shuō),在腸道中占據(jù)著很大比例。

    作者們分析了很多的臨床數(shù)據(jù),綜述了一些研究文章,他們認(rèn)為這些來(lái)自食物的菌群確實(shí)影響著腸道微生物群和宿主健康。從食物進(jìn)入腸道的很多益生菌確實(shí)能夠進(jìn)入小腸,而且躲過(guò)了胃里的強(qiáng)酸環(huán)境而仍然頑強(qiáng)的或者,并還有生理活性,可以完成一些分子的合成代謝。這些微生物占據(jù)著正常腸道微生物群體的一部分,并且很多次在腸道微生物群的分析中被檢測(cè)出來(lái)。

    實(shí)際上,很多研究都表明,通過(guò)食物進(jìn)入人體的這些益生菌,對(duì)原有的微生物菌群的組成并沒(méi)有太大的影響,但是對(duì)某些特定的微生物群體會(huì)產(chǎn)生影響。例如,會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)短鏈脂肪酸菌群增加,從而使得產(chǎn)蛋白菌群數(shù)量減少,這是這些微生物導(dǎo)致碳水化合物代謝變化的一個(gè)例子。此外,這些來(lái)自食物的微生物也會(huì)影響著嬰兒腸道微生物菌群的形成。

    合理地選擇研究的微生物類型,并通過(guò)臨床研究來(lái)確認(rèn)他們的功能,這或許能夠讓我們研發(fā)新一代的可食用益生菌,幫助我們解決身體困擾。

    11.Immunity:免疫細(xì)胞幫助腸道好細(xì)菌戰(zhàn)勝壞細(xì)菌

    美國(guó)芝加哥大學(xué)科學(xué)家在《免疫》期刊上撰文指出,身體內(nèi)的免疫系統(tǒng)可能是健康腸道菌群“衛(wèi)士”。他們發(fā)現(xiàn),白血球中的一種單一結(jié)合蛋白質(zhì)可能影響小鼠的腸道菌群是否平衡。如果沒(méi)有該蛋白質(zhì),小鼠更容易感染有害細(xì)菌。

    fu及其合作者發(fā)現(xiàn),當(dāng)缺少一種名為id2的蛋白質(zhì)時(shí),一種名為固有淋巴細(xì)胞3型的腸道免疫細(xì)胞(ilc3)對(duì)有害細(xì)菌感染的響應(yīng)能力就會(huì)減弱。缺乏id2的ilc3無(wú)法產(chǎn)生一種名為il-22的分子,該分子能**其他腸道細(xì)胞產(chǎn)生抗菌的縮氨酸(amp),從而幫助身體抵抗病原菌感染。但正常細(xì)菌似乎對(duì)amp具有更強(qiáng)的抵抗力。
    12. 可不止長(zhǎng)相,我們還從父母那兒遺傳了細(xì)菌

    美國(guó)**衛(wèi)生研究院(NIH)發(fā)起研究的“人類腸道微生物組計(jì)劃”產(chǎn)生的大量基因數(shù)據(jù)和最近的一些研究都有力的證明了和我們共生的微生物就像基因一樣從我們遠(yuǎn)古的靈長(zhǎng)類祖先一代一代傳給了我們。這種兩代間的遺傳從嬰兒出生的那一刻就開(kāi)始了:嬰兒會(huì)在母親**中會(huì)全身“沾滿”微生物,嘴巴里頭也會(huì)吃到一點(diǎn),也正是這些微生物扮演了構(gòu)成孩子腸道菌群的急先鋒。媽媽的乳汁里頭也會(huì)有專門能夠促進(jìn)這些腸道菌群繁衍的營(yíng)養(yǎng)成分。除此之外,媽媽的皮膚和嘴巴也是寶寶最初能夠獲得微生物的重要來(lái)源。

    現(xiàn)代諸如抗生素和奶粉這樣的產(chǎn)品可能破壞了孩子從父輩那兒繼承獲得有益菌群的權(quán)利。當(dāng)這些沖擊破壞超過(guò)了菌群自我修復(fù)能力的時(shí)候,惡果產(chǎn)生了:有證據(jù)表明孕婦在產(chǎn)前和產(chǎn)后使用抗生素后,孩子長(zhǎng)大以后得肥胖,糖尿病,乳糜瀉,哮喘和過(guò)敏等疾病的風(fēng)險(xiǎn)大大上升。當(dāng)下抗生素的濫用造成了這樣的危機(jī),是時(shí)候正視我們繼承的細(xì)菌遺產(chǎn),有效地去利用他們,為我們的健康造福。

 


 
 

 


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